หลังจากที่อุกกาบาตปล่อยสัตว์สามหัวโจมตีโตเกียว มอธราพยายามรวมตัวกับก็อดซิลล่าและโรดันเพื่อต่อสู้กับภัยคุกคามจากนอกโลก
